غالبا ما يتم استخدام الخلايا الجذعية في عمليات الزرع للمساعدة في علاج بعض سرطانات الدم ونخاع العظم أو أمراض الثلاسيميا أو مرض الخلية المنجلية. في حال كانت الخلايا المستخدمة ذاتية (لاستخدام الفرد نفسه) فيمكن لهذه الخلايا أن تتمكن من استعادة خلايا الدم والجهاز المناعي بعد العلاج الكيميائي المستخدم في علاج العديد من الأمراض. في حال كانت الخلايا المستخدمة غير ذاتية (أي من أحد الأشقاء) فلا يمكن أن تساعد على استعادة خلايا الدم والجهاز المناعي فحسب، إنما تلعب دوراً هاماً في تدمير الخلايا السرطانية.
كما يمكن استخدام الخلايا الجذعية في الطب التجديدي للمساعدة في إصلاح أو استبدال الأنسجة أو الخلايا التالفة أو المريضة. مازالت هذه التطبيقات التجديدية حديثة نوعا ما، وغالباً ما يتم إجراؤها كجزء من الأبحاث والتجارب السريرية. شاهد المزيد من المعلومات على الموقع الإلكتروني الخاص بمركز Smart Cells.